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Initiation au logiciel de bibliographie, Zotero

Extrait du compte-rendu du séminaire du 31 octobre 2012.

Séminaire de méthodologie des doctorants de l’ED1

Compte-rendu de la séance du 31 octobre 2012.

 

Quelques actualités sont échangées au début du séminaire :

  • URFIST de Paris, Ecole nationale des Chartes, 17 rue des Bernadins, 75005 PARIS. 0143268522 ou secretariat.urfist@enc.sorbonne.fr, site internet : http://urfist.enc.sorbonne.fr/ et blog : http://urfistinfo.hypotheses.org/. Formation aux techniques de l’information (usages des outils web, évolution des traitements de l’information – web 2.0 et Web sémantique, zotero, traitement de l’édition scientifique en ligne, bases de données, environnement éditorial du chercheur – bibliométrie, publications…). Conception d’outils en ligne : tutoriels, supports de cours, suivi d’ateliers. Flux RSS, mise en ligne des articles (accès gratuits)…Formation gratuite pour les doctorants et enseignants. Sur place, possibilité de consulter un guide de ressources électroniques. Nombreux tutoriaux en ligne.
  • Présentation de l’IRIS PEN : stylo scanner qui permet de numériser un texte grâce à un logiciel d’OCR. Il fonctionne dans de nombreuses langues et est particulièrement utile puisqu’il permet d’éviter la copie laborieuse de textes non encore numérisés.
  • Présentation du blog « aspect concret de la thèse ». http://act.hypotheses.org/ et de son séminaire, 1er et 3e lundis du mois de 13 h à 15 h.
  • Présentation du blog du séminaire : http://mam.hypotheses.org/.

 

 

ZOTERO, logiciel de bibliographie (par Céline Ménager) :

Principes

Il s’agit à l’origine d’une extension du navigateur internet Mozilla Firefox qui fonctionne aujourd’hui pour d’autres navigateurs. Le logiciel se télécharge là : http://www.zotero.org. Le logiciel fonctionne ensuite comme une barre d’action ou un onglet de fenêtre, inséré au sein de la fenêtre principale de navigation sur internet.

Son principe est de permettre l’importation, la création et l’exportation de notices bibliographiques dans une « bibliothèque » numérique personnelle et sauvegardée en ligne (donc accessible depuis tout ordinateur disposant d’une connexion internet). Celles-ci peuvent être ensuite classées et rangées selon les choix du compilateur.

Pour ce faire, le logiciel crée une base de données qui contient l’ensemble des références enregistrées. Cela peut ralentir le fonctionnement du navigateur, mais on peut le désactiver quand on n’en a pas l’utilité.

ZOTERO est un logiciel open source. Il est donc gratuit et régulièrement mis à jour par la communauté scientifique en fonction des besoins des chercheurs. Cela est un de ses nombreux atouts.

 

Intérêts

ZOTERO offre à ses utilisateurs une sauvegarde en ligne de leurs bibliographies qui les met à l’abri de toute casse informatique ou perte de sauvegarde. Il permet de gérer ses références avec de nombreux outils : mots-clés, notes. Mais surtout il offre un rendu final uniforme et permet d’automatiser une tâche fastidieuse de la rédaction.

 

 

Le logiciel ZOTERO présente une fenêtre en 3 parties : à gauche une arborescence des collections, au centre la liste des ouvrages présents dans une collection, à droite le détail de la notice sélectionnée.

 

Comment créer une entrée ?

Pour créer une entrée, il faut cliquer sur nouveau document (l’icône représentant un plus blanc sur un rond vert). On sélectionne alors le type de document (livre, article de revue, chapitre de livre, actes de colloque…). On peut ensuite remplir les champs dans la colonne de droite. Les champs varient en fonction du type de document sélectionné.

 

Comment récupérer une entrée à partir d’un catalogue en ligne ?

Le logiciel Zotero est compatible avec des sites de catalogue en ligne : SUDOC, Brepolis (IMB et bibliographie de civilisation médiévale), BNF, BIU Sorbonne par exemple. Cela lui permet d’importer directement la fiche bibliographique d’un ouvrage (titre, auteur, éditeur, année, ISBN etc.) tout en récupérant et en sauvegardant le lien direct vers la notice et les mots-clés utilisés par le catalogue.

Quand le site est compatible avec zotero, une icône apparait à côté de l’adresse du site qui figure un livre ou un livre ouvert (pour les articles). Il suffit alors de cliquer sur cette icône et la notice est enregistrée dans la base de données, dans la collection active au moment de l’action. A défaut, la référence se retrouvera en cliquant sur « Ma bibliothèque ».

Il faut toutefois se méfier de cet enregistrement automatique. Le logiciel n’identifie pas toujours de façon juste les balises du site et peut confondre certaines informations (nom du directeur d’ouvrage dans le titre par exemple). De plus, certaines références peuvent être erronées dans le catalogue.

ZOTERO, en plus des ouvrages, peut conserver des documents liés, par exemple lorsqu’ils sont mis en ligne (pdf). Il stocke aussi les pages web pour les citer.

 

Comment organiser les données ?

Les références peuvent être organisées par collection (l’équivalent des dossiers de l’explorateur windows). Pour créer une collection, il faut cliquer sur l’icône à l’extrême gauche. On peut ensuite donner un nom à la collection. On obtient le même résultat en cliquant avec la souris (clic droit) sur « Ma bibliothèque ». On peut ensuite créer des sous-collections. On remplira les collections en créant directement une référence dans la collection ou en faisant glisser une référence vers la collection concernée (la référence est alors copiée).

Il existe une copie de toutes les références dans « Ma bibliothèque ». Dans le cas où on chercherait une référence sans connaître la collection dans laquelle elle est rangée, il faut faire la recherche depuis « Ma bibliothèque ».

 

Comment importer des références ?

Zotero est compatible avec de nombreux logiciels de bibliographie et permet d’importer des bibliographies dans de nombreux formats (action importer).

Pour récupérer une ancienne bibliographie, on peut passer de Word à ZOTERO à partir d’une démarche expliquée ici : http://zotero.hypothèses.org/123. Mais le passage par le SUDOC peut s’avérer à l’usage plus satisfaisant.

 

Comment exporter des références ?

Une fois la bibliographie importée sous ZOTERO, il est possible de l’exporter vers un fichier word (ou open office)  pour générer automatiquement une bibliographie scientifique.

Il faut d’abord télécharger un plugin Word/Zotero : http://www.zotero.org/support/word_processor_intégration

Une autre opération consiste à sélectionner sous ZOTERO le dossier bibliographique (ou simplement un sous-dossier) avec un clic droit. Puis de sélectionner l’option « créer une bibliographie » et « copier dans le presse-papier ». Ensuite, il ne reste plus qu’à coller celle-ci dans le fichier Word.

ATTENTION, pour que cette opération donne un résultat utilisable, il faut passer par l’installation de normes bibliographiques nouvelles dans ZOTERO qui par défaut fonctionne en normes anglaises. Des normes françaises de sciences humaines sont disponibles sur :

http://www.zotero.org/trac/ticket/1216

http://zotero.hypothèses.org/category/styles

http://forums.zotero.org/discussion/4738/3/french-citation-style-de-citation-en-francais/

http://www.boiteaoutils.info/p/csl-france-styles-pour-zotero.html

Celles-ci sont au format .csl, et s’installent en sélectionnant le choix « ouvrir avec Firefox » et « ok » à la proposition « installer ».

ZOTERO facilite la citation en note de bas de page sur le même principe. Sélectionner un item. « Créer bibliographie ». « Copier presse-papier ». Coller en note.

 

 

 

Des formations à ZOTERO gratuites sont proposées par l’URFIST, si un partenariat existe entre celle-ci et la structure d’accueil du doctorant.

Sinon, des sites sont disponibles :

http://wiki-urfist.unice.fr/wiki_urfist/index.php/ZOTERO_un_logiciel_de_bibliographie_2.0 (mais pas à jour)

http://www.zotero.org/support/fr/start

http://zotero.hypotheses.org/

http://alopensource.blogspot.com/2010/11/zotero-en-video.html

Pour d’autres logiciels (articles de comparaison).

http://en.wikipedia.org/wiki/Comparaison_of_reference_management_software

Plus récemment deux articles sur le blog La boite à outils des historiens :

http://www.boiteaoutils.info/2012/10/gerer-la-documentation-i-quelques.html

http://www.boiteaoutils.info/2012/11/gerer-la-documentation-ii-une-approcha.html

Comment ajouter des éditeurs scientifiques dans une notice de Zotero ?

De prime abord cela ne semble pas évident. Si on importe la notice à partir d’un catalogue, les éditeurs sont souvent intégrés au titre. Cela pose un problème lors de l’édition de la bibliographie puisqu’ils apparaissent alors après le titre et en italique.

Il existe plusieurs entrées qui pourraient correspondre à notre besoin. On trouve en effet une entrée édition et une entrée éditeur. Mais l’entrée édition sert à renseigner s’il s’agit d’une 2e ou 3e édition (attention tous les styles ne prennent pas en compte cette entrée). Quant à l’éditeur il s’agit de ce que nous appelons la maison d’édition.

Pour entrer un éditeur scientifique, il faut intervenir au niveau de l’auteur. Il faut créer un nouvel auteur dont le statut sera « éditeur ». Comment faire ? A droite de l’auteur, cliquez sur le + qui vous permet de rajouter un nouvel auteur. Entrez le nom de ce nouvel auteur puis changez-en le statut en cliquant sur la petite flèche à gauche du nom. Un menu déroulant vous propose alors auteur, éditeur, collaborateur, auteur critique ou traducteur.

Si vous voulez entrer un article qui fait partie d’un recueil, choisir « chapitre de livre » pour l’entrée « type de document ».

Cette astuce vous permet également de lever toute confusion entre auteur et traducteur.

Compte-rendu du séminaire du 23 février 2011

Présents : Lucie Claire, Emilie Deschellette, Barbara Falleiros, Ana Maria Misdolea, Céline Ménager, Charles Nicolas, Elisabeth Piazza, Elodie Romieux-brun, Camille Rouxpetel, Aurore Violas.

En introduction, le séminaire commence par un tour de table rapide de présentation des participants, avec pour certains l’apport d’information en lien avec l’actualité de la recherche et des études doctorales. Plusieurs points sont ainsi abordés.

Bourses pour l’EFR et la Vaticane : Deux sessions de dépôt de demande ont lieu chaque année, le 31 mars et le 31 septembre. Ces bourses sont mensuelles mais sont parfois adaptables pour les enseignants du secondaire.

Questes : le bulletin de cette association de médiéviste est présenté ainsi qu’un appel à contribution sur la relation à l’autre au Moyen-âge.

« Ambedeus : normes, réalités et inventions de la relation à l’autre au Moyen Âge

Journée d’études interdisciplinaires organisée par le groupe de doctorants médiévistes Questes, le samedi 11 juin 2011 en Sorbonne »

http://www.fabula.org/actualites/ambedeus-normes-realites-et-inventions-de-la-relation-a-l-autre-au-moyen-age_41925.php

Séminaire : Paris I organise un séminaire de statistiques et de mathématiques pour historiens.

http://lamop.univ-paris1.fr/spip.php?rubrique183

Ressources internet : présentation du blog aspect concret de la thèse.

http://act.hypotheses.org/

A noter également le séminaire de l’EHESS sur les aspects concrets de la thèse.

La séance se poursuit ensuite par les différents points proposés lors de la précédente réunion, en bénéficiant désormais d’un matériel de vidéo-projection.

ZOTERO, logiciel de bibliographie (par Céline Ménager) :

Il s’agit d’une extension du navigateur internet Mozilla Firefox.

Le premier logiciel se télécharge ici : http://www.mozilla-europe.org/firefox/

Le second là : http://www.zotero.org

Le logiciel fonctionne ensuite comme une barre d’action ou un onglet de fenêtre inséré au sein de la fenêtre principale de navigation sur internet.

Son principe est de permettre l’importation, la constitution et l’exportation de notices bibliographiques dans une « bibliothèque » numérique personnelle centralisée. Celles-ci peuvent être ensuite classées et rangées selon les choix du compilateur.

Par exemple, sa comptabilité avec le SUDOC permet d’importer directement la fiche bibliographique d’un ouvrage (titre, auteur, éditeur, année, ISBN etc.) tout en récupérant et en sauvegardant le lien direct vers la notice ou encore l’architecture des liens internes du catalogue.

Il est également compatible avec le site Brepols, mais non avec celui de la BNF.

ZOTERO, en plus des ouvrages, peut compiler des références d’articles, par exemple lorsqu’ils sont mis-en-ligne. Il stocke aussi les pages web pour les citer. Il peut enfin capturer les pages d’articles pour les associer à une référence.

ZOTERO est un logiciel gratuit open source et connait donc de nombreux ajouts (plugin) mais aussi quelques cafouillages de fonctionnement que l’usage apprendra. Ainsi, il est conseillé de toujours entrer les noms d’auteur en minuscule.

Pour récupérer une ancienne bibliographie, on peut passer du word à ZOTERO à partir d’une démarche expliquée ici : http://zotero.hypothèses.org/123.

Sinon le passage par le SUDOC peut s’avérer à l’usage plus satisfaisant.

Enfin, une fois la bibliographie importée sous ZOTERO, il est possible de l’exporter vers un fichier word (ou open office)  pour générer automatiquement une bibliographie scientifique.

Il faut d’abord télécharger un plugin Word/Zotero : http://www.zotero.org/support/word_processor_intégration

Une autre opération consiste à sélectionner sous ZOTERO le dossier bibliographique (ou simplement un sous-dossier) avec un clic droit. Puis de sélectionner l’option « créer une bibliographie » et « copier dans le presse-papier ». Ensuite, il ne reste plus qu’à coller celle-ci dans le fichier Word.

ATTENTION, pour que cette opération donne un résultat utilisable, il faut passer par l’installation de normes bibliographiques nouvelles dans ZOTERO qui par défaut fonctionne en normes anglaises. Des normes françaises de sciences humaines sont disponibles sur :

http://www.zotero.org/trac/ticket/1216

http://zotero.hypothèses.org/category/styles

http://forums.zotero.org/discussion/4738/3/french-citation-style-de-citation-en-francais/

Celles-ci sont au format .csl, et s’installent en sélectionnant le choix « ouvrir avec Firefox » et « ok » à la proposition « installer ».

ZOTERO facilite la citation en note de bas de page sur le même principe. Sélectionner un item. « Créer bibliographie ». « Copier presse-papier ». Coller en note.

Des formations à ZOTERO gratuites  sont proposées par l’URFist, si un partenariat existe entre celle-ci et la structure d’accueil du doctorant.

Sinon, des sites sont disponibles :

http://wiki-urfist.unice.fr/wiki_urfist/index.php/ZOTERO_un_logiciel_de_bibliographie_2.0 (mais pas à jour)

http://www.zotero.org/support/fr/start

http://zotero.hypotheses.org/

http://alopensource.blogspot.com/2010/11/zotero-en-video.html

Pour d’autres logiciels (articles de comparaison).

http://en.wikipedia.org/wiki/Comparaison_of_reference_management_software

En lien avec ce logiciel, deux autres outils sont mentionnés.

Xmarks : http://www.xmarks.com

Xmarks est un système de stockage en ligne, qui permet entre autre de stocker les marques-pages du navigateur web. Sa capacité de synchronisation facilite le travail à partir différents postes informatiques, par l’échange de fichier, leur mise-à-jour automatique et l’importation de paramètre d’utilisateur.

Dropbox : http://www.dropbox.com

La Dropbox fonctionne comme un disque dur en ligne limité à 2 Go. Elle permet également l’échange dématérialisé de fichier et la synchronisation de documents entre plusieurs postes informatiques.

LaTeX (par Elodie Romieux):

Ce logiciel de mise en forme permet de gérer la bibliographie mais également et surtout la citation et l’importation de citation en langues « exotiques », à savoir dans la majorité des cas le grec ancien.

Un site de référence en français :

http://www.tuteurs.ens.fr/logiciels/latex/

Sa principale difficulté est l’importance des commandes à maîtriser. Ainsi, dans le cadre de ce séminaire, on ne pourra aller au-delà d’une simple première prise de contact, même s’il sera toujours possible d’y revenir ultérieurement.

Le principe de base repose sur l’utilisation conjointe d’un ficher LaTeX écrit sous la forme de code et d’un traitement de texte. LaTeX génère ainsi à partir du fichier-source un fichier texte directement exploitable (bibliographie, texte). Par la suite, tout changement de mise-en-page ou de typographie se gère directement dans le fichier LaTeX pour s’appliquer à l’ensemble du fichier. Il n’est ainsi pas nécessaire de modifier une à une chaque entrée du ficher world (ex : mettre en italique ou non le titre d’une revue).

Point questions diverses:

Le séminaire aborde le problème des polices grecques et plus généralement des polices Unicode.

L’Unicode est une technique de codage des polices de traitement de texte qui permet leur reconnaissance universelle sans en posséder l’original. Dans la pratique, les polices Unicode sont de plus en plus nécessaires aux doctorants dès lors qu’ils doivent transmettre un article ou du texte sous la forme d’un fichier word ou autre (c’est-à-dire non .pdf) à un interlocuteur. Dans le cas contraire, le récepteur ne pourra pas lire le texte écrit dans la police choisit par l’auteur, sauf si il l’installe en plus (ce qui est souvent délicat).

Par exemple, le TLG est Unicode.

De plus, une police Unicode en grec ancien est souvent associée à un clavier polytonique.

(Le site de l’UFR de Grec offrait des ressources sur ce point jusqu’à sa refonte complète)

La question de la mise en valeur du séminaire est débattue en fin de séance. Devant la perspective de la refonte du site de la Sorbonne (effective au 1er mars), les participants s’interrogent sur les possibilités d’hébergement en ligne des comptes-rendus du séminaire. Entre la plateforme Moodle et l’hébergement sur le blog « Hypothèse », c’est ce second choix qui l’emporte.

AGENDA :

Le prochain séminaire est fixé au 23 mars, de 18h à 20h, dans la même salle (consulter les Actualités du site de l’ED 1). Charles Nicolas est chargé de préparer une présentation de l’Index sous Word (il prévient néanmoins de son léger retard probable). Céline Ménager propose d’aborder de son côté les flux RSS.